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一、领域概述
消化系统从口腔延续到肛门,负责摄入食物、将食物粉碎成为营养素(这一过程称为消化)、吸收营养素进入血液,以及将食物的未消化部分排出体外。消化道包括口腔、咽、食管、胃、小肠、大肠、直肠和肛门,还包括一些位于消化道外的器官:胰腺、肝脏和胆囊。
常见的疾病有:胃肠道炎症、出血、机械性肠梗阻、麻痹性肠梗阻、食管炎、脏器衰竭、酒精肝,脂肪肝等。
二、常见通路
一般炎症性的肠胃炎主要是由于外界刺激引起的炎症反应,会破坏消化道的内表皮细胞,导致消化道内表皮和内基质损伤。表现出肠胃病,与此同时随着内皮和基质细胞的损伤,细胞基质中的蛋白也会出现粪便或血液中。检测样本中的标志蛋白即可。比如:胃黏膜损伤检测胃蛋白酶PP,胃泌素释放肽前体ProGRP的含量上升。通路研究较多的有:
1、Sphingosine kinase and sphingosine-1-phosphate receptor signaling pathway
2、JAK/STAT2 Signal Pathway
3、Retinoic acid Signal Pathway
4、ERK Signal Pathway
三、常见基因
(列举此类疾病相关性前50的基因名称)
KIT | TNF | IL6 | PDGFRA | IL10 |
TP53 | NOD2 | APOE | IL1B | CD40LG |
VEGFA | IFNG | TLR4 | INS | TGFB1 |
SDHC | APP | F2 | SNCA | HLA-DRB1 |
APC | SDHB | AKT1 | PTEN | CTLA4 |
MTHFR | CCR6 | TLR4 | VWR | EGFR |
RET | CDKN2A | KRAS | SMAD4 | STAT3 |
CRP | GBA | TLR2 | FAS | HLA-DQB1 |
ABCB1 | PRNP | CCL2 | HLA-B | BRAF |
CDH1 | ERBB2 | CTNNB1 | LMNA | MPO |
四、疾病动物模型
常见的动物疾病模型见下表:
模型名称 | 应用动物 | 建模方法 |
肝缺血(HI) | 大鼠、小鼠、豚鼠、兔 | 缺血再灌注肝损伤 |
肝纤维化(HF) | 大鼠、小鼠 | CCL4 致肝纤维化,二甲基亚硝胺诱导 |
肝功能衰竭(LF) | 大鼠、小鼠、兔、犬 | 肝切除诱发肝衰竭 |
酒精性肝病(AH) | 大鼠、小鼠、兔 | 乙醇灌胃加高脂喂养 |
肝硬化(LC) | 大鼠、小鼠、兔、犬 | 四氯化碳诱发肝硬化 |
食管炎 | 小鼠 | 酸灌注法、半幽门缝扎加贲门肌切开术 |
急性胃溃疡(AGU) | 大鼠、小鼠 | 乙酰水杨酸、水浸拘束、幽门结扎诱发 |
结肠炎 | 大鼠、小鼠、兔 | 乙酸诱导、葡聚糖硫酸钠诱导 |
克罗恩病(CD) | 大鼠 | 注射三硝基苯磺酸 |
胆囊炎 | 大鼠、小鼠、兔 | 总胆管结扎加细菌感染致胆囊炎 |
肠易激综合征(IBS) | 大鼠、小鼠 | 束缚应激、冰水刺激 |
肝炎 | 大鼠、小鼠、兔 | 刀豆蛋白A(ConA)诱导的肝炎 |
肝内胆汁淤积(IC) | 大鼠、小鼠 | α-萘基异硫氰酸注射、胆管结扎 |
胆结石(GS) | 大鼠、小鼠 | 用致石饲料致胆囊胆固醇结石(GCD) |
食管狭窄(ES) | 大鼠、小鼠、兔 | 食管狭窄 |
食管静脉曲张(EV) | 大鼠、小鼠 | 门静脉结扎手术 |
急性胃炎(AG) | 大鼠、小鼠 | 灌胃加药导致急性胃炎 |
慢性胃溃疡(CGU) | 小鼠 | 乙酸烧灼法诱发慢性胃溃疡 |
十二指肠溃疡(DU) | 大鼠、小鼠 | 乙酸、半胱胺诱发 |
肠粘连(IA) | 大鼠、小鼠、兔 | 手术致肠粘连 |
腹腔感染(AI) | 大鼠、小鼠 | 盲肠结扎穿孔(CLP)法导致 |
坏死性小肠结肠炎(NEC) | 大鼠 | 人工喂养以及缺氧和冷刺激诱导的新生儿坏死性小肠结肠炎 |
腹腔间隔室综合征(ACS) | 大鼠 | 琥珀明胶诱导的腹腔间隔室综合征 |
肝外胆汁淤滞(EC) | 大鼠、小鼠、兔 | 结扎胆管致肝外胆汁淤滞 |
慢性胰腺炎(CP) | 大鼠、小鼠 | 二氯二丁基致慢性胰腺炎 |
胰腺微循环障碍(PMF) | 大鼠、小鼠 | 手术方法致胰腺微循环障碍 |
功能性消化不良(FD) | 大鼠 | 不规则饮食加稀盐酸喂养 |
黄疸 | 小鼠 | 胆总管双重结扎法导致梗阻性黄疸 |
检测分析 靶向代谢组学 蛋白组学 Elisa检测 生化分析 元素分析 成分分析 土壤检测 血生化检测 中药指纹图谱 农残检测 植物激素检测 非靶向代谢组学 支原体检测
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